Ὁ δὲ Ἅγιος ἔτυχε τότε εἰς τὸ Πατριαρχεῖον καὶ συνωμίλει μετὰ τεσσαράκοντα Ἀρχιερέων φίλων του, οἵτινες ἔκλαιον διὰ τὴν ἄδικον καὶ παράνομον Σύνοδον τοῦ Θεοφίλου, καὶ ἔλεγον, ὅτι κάλλιον εἶναι νὰ ἀφήσωσι τοὺς θρόνους των, παρὰ νὰ συλλειτουργήσωσι μὲ τοὺς Ἀρχιερεῖς ἐκείνους ἢ νὰ ὑπογράψωσιν εἰς τὴν καθαίρεσιν τοῦ Ἁγίου. Ὁ δὲ Ἅγιος τοὺς παρηγόρει, λέγων· «Ἐὰν μὲ ἀγαπᾶτε, συλλειτουργήσατε μὲν μετ᾽ ἐκείνων, διὰ νὰ μὴ γίνῃ σχίσμα εἰς τὴν Ἁγίαν τοῦ Θεοῦ Ἐκκλησίαν, εἰς δὲ τὴν καθαίρεσίν μου μὴ ὑπογράψετε, διότι δὲν γνωρίζω τι ἀπ᾽ ὅσα μὲ κατηγοροῦσι».
Λέγοντος τοῦ Ἁγίου ταῦτα, ἔφθασαν καὶ οἱ ἀπεσταλμένοι ὑπὸ τῆς παρανόμου Συνόδου φέροντες τὴν ἀπόφασιν, ἥτις διελάμβανε ταῦτα. «Ἡ Ἁγία Σύνοδος, ἡ ἐπὶ Δρῦν ἀθροισθεῖσα, τῷ Ἰωάννῃ»· ὤ τῆς ἀπωλείας! μόνοι των ὠνομάζοντο Ἅγιοι καὶ τὴν μικρὰν Σύνοδόν των Ἁγίαν ὠνόμασαν, τὸν δὲ Ἅγιον οὐδὲ κἂν Πατριάρχην ὠνόμασαν, ἀλλ’ ἁπλῶς Ἰωάννην, πρὸ τῆς ἐξετάσεως ποιοῦντες αὐτοὶ τὴν ἀπόφασιν. Ἔγραφον δὲ ἐν συνεχείᾳ τὰ ἑξῆς· «Λιβέλλους ἐδεξάμεθα κατὰ σοῦ, πολλῶν αἰτιαμάτων μεστούς· χρὴ οὖν ἀπαντῆσαί σε τὸν ὑπὲρ αὐτῶν ὑφέξοντα λόγον»· ἤτοι, πρέπει νὰ ἔλθῃς νὰ δώσῃς ἀπόκρισιν διὰ τὰ ἐγκλήματα ταῦτα. Ὁ δὲ Ἅγιος ἔστειλε πρὸς αὐτοὺς τρεῖς Ἐπισκόπους, Δημήτριον τὸν Πισινοῦντος, Εὐλύσιον τὸν Ἀπαμείας, Λουππικιανὸν τὸν Ἀπιαρίας καὶ δύο Ἱερεῖς, νὰ εἴπωσι πρὸς ἐκείνους τοιαῦτα· «Ἐγὼ δὲν ἀποφεύγω ἀπὸ τὴν Σύνοδόν σας, Ἅγιοι Ἀρχιερεῖς, ἔστω καὶ ἐὰν εἶσθε καὶ ἄλλοι ἑκατόν, ἀλλὰ παραμερίζω ἀπὸ τὸν φανερὸν ἐχθρόν μου, τὸν Θεόφιλον, ὁ ὁποῖος, πρὶν ἀπαντήσῃ διὰ τὰ ἴδια αὐτοῦ ἐγκλήματα, γίνεται κριτὴς ἐναντίον μου καὶ ταῦτα τοῦ νόμου ἐμποδίζοντος, καθὸ διακελεύοντες τὸν ἀπὸ τῆς Αἰγύπτου μὴ κρίνειν εἰς τὰ σύνορα τῆς Θρᾴκης».
Οἱ μὲν ἀπεσταλμένοι ὑπὸ τοῦ Ἁγίου τοιαῦτα εἶπον· οἱ δὲ, λύκοι καὶ οἱ ποιμένες, συλλαβόντες τοὺς Ἀρχιερεῖς καὶ Ἱερεῖς ἐκείνους, τοὺς ἔσυραν δέροντες καὶ σχίσαντες τὰ ἐνδύματά των ἔβαλον ἕκαστον εἰς τὰ σίδερα, ἅτινα εἶχον ἑτοιμάσει διὰ τὸν Ἅγιον. Καὶ διὰ νὰ μὴ φαίνεται εἰς τὸ φανερὸν ἡ κακουργία των, τοὺς ἐφυλάκισαν εἰς κεκρυμμένον τόπον πρὸς ἐκφόβισιν τῶν ἄλλων, ἔπειτα ἐβιάσθησαν καὶ ὑπέγραψαν καὶ οἱ τεσσαράκοντα πέντε Ἀρχιερεῖς τὴν καθαίρεσιν τοῦ Ἁγίου, ἤρχισαν δὲ νὰ ὑπογράφουν κατὰ τὴν τότε συνήθειαν πρῶτον οἱ μικρότεροι καὶ τελευταῖον οἱ μεγαλύτεροι· ὑπέγραψε δὲ πρῶτος Ἐπίσκοπός τις Γυμνάσιος ὀνόματι καὶ τελευταῖος ὁ κακοῦργος Ἀλεξανδρείας Θεόφιλος.